El 1º de diciembre de 1891 se abrían las cajas de una gran institución: el Banco de la Nación Argentina. El nuevo Banco llevó a la conciencia pública el convencimiento de que el Banco Nacional correspondía a los dominios del pasado cuyas contaminaciones convenía evitar, y el Banco de la Nación respondía al porvenir, al crédito sano y vigoroso del país.
Las desastrosas inundaciones en el valle inferior del rio Chubut en las postrimerías del siglo XIX, hicieron que una de las importantes oficinas asentadas en Rawson se trasladara a Trelew, donde en una finca propiedad de Lewis Jones quedaría definitivamente la sucursal del Banco de la Nación. Para 1916, el movimiento bancario en el valle inferior del río Negro había aumentado considerablemente, existían ya sucursales de este banco tanto en Carmen de Patagones como en Viedma. También abría sus puertas la sucursal de San Antonio Oeste.
El 14/02/1912 se abría una sucursal de esta casa en Ushuaia, cuando ya existía la sucursal de Río Gallegos. En esta fecha llegaron el director y gerente y un contador que la organizaron. Con el tiempo dispondría del mejor edificio de Ushuaia, que alberga actualmente al Museo Territorial. La sucursal Comodoro Rivadavia se estableció y abrió sus oficinas al público el 16/03/1908. Ocupaba entonces un local entre las calles San Martín y Moreno, que luego fue destruido por un incendio. En 1921 se inauguró la casa propia, y ese mismo año se habilitó un imponente edificio arquitectónico, que fue demolido a mediados de los años ’70, para levantar el actual.
Para 1925 se habilitó la sucursal de Esquel y diez años después el territorio de Santa Cruz ya contaba con cuatro sucursales: Río Gallegos, Santa Cruz, San Julián y Puerto Deseado.
En Río Grande -Tierra del Fuego- se estableció una sucursal del Banco de la Nación Argentina en 1943.
La sucursal de esta institución en la ciudad de Caleta Olivia, abrió sus puertas en noviembre de 1972.
El 21/08/1977 la sucursal de Comodoro Rivadavia inauguró su nuevo edificio, sito en la misma dirección en que se levantaba la histórica sede.